国民党当然拥有更强的正当性要求重查“三一九枪击案”。因为不但是国民党自己，而且连社会舆论也都认为，是枪击案令本来胜算在望的“连宋配”的选情一夕翻盘。因此，在投票日当晚选票点算结果尚未正式公布之时，连战、宋楚瑜就提出了“选举无效之诉”和“当选无效之诉”，主诉理由除了是怀疑民进党“作票”之外，就是民进党以制造枪击案来影响选举结果，图使他人不当选。

    尽管从现实政治看，“连宋配”不尽然能产生“一加一等于二”的效果，但枪击案的发生，及枪击案当晚蓝军的处置失误（如“连宋配”竞选总部先是宣布停止竞选活动，后是没有向“中选会”提出延后投票请求；又如陈文茜在电视节目中声称有奇美医院小护士揭发内幕等），使到有可能获胜的“连宋配”一夕翻盘，却又是明摆着的。因此，说泛蓝阵营及连战、宋楚瑜是枪击案的最大受害者，并不为过。

    但事物总是一分为二的。虽然“三一九枪击案”对二零零四年“总统”大选结果有着相当大的影响，使“连宋配”几乎已到手的胜选果实被陈水扁抢走了，但却又对台湾地区日后的政治局势发展埋下了“指向性”影响的伏线，为四年后马英九的胜选，以至国民党有可能长期执政，民进党也有可能长期一蹶不振，提供了极佳的“拐角点”。

    文章认为，正是枪击案的发生，不管是陈水扁自编自导，还是其他的什么动机驱使，都使陈水扁感到要胜选“总统”并不容易。这使陈水扁产生了“有权不用，过期作废”的念头，趁在离任之前，大肆贪掠，以备日后离任后享受。另一方面，也使一心要在二零一二年趁自己尚年轻而第三次再选“总统”的陈水扁，担心在二零零八年不管是何人当选“总统”，自己都因已离任而无法敛财，而决心要抢在离任前积蓄到足够财力作竞选经费，而在其第二任“总统”任内，进行大肆贪污受贿，从而为自己和民进党都挖掘了坟墓。

    也因为是“枪击案”的发生，导致泛蓝阵营极为不满，连续多日进行“要真相”街头运动，为两年后的百万“红衫军”发起“反贪倒扁”街头抗争行动，积聚了正当性及强大能力。这两次声势浩大的群众街头抗争行动，直接促成了民进党垮台，把马英九拱上了“总统”宝座，并促使国民党控制了“立法院”。

    更正是枪击案的发生，使落选了的连战、宋楚瑜，能够抛弃一切政治包袱，理直气壮地踏上祖国大陆的土地进行“和平之旅”，分别与中共总书记胡锦涛达成“两岸和平发展共同愿景”和“会谈公布”，为两岸关系和平发展奠定了政治基础。尽管说，倘若当年“连宋配”胜选，两岸关系也将会向利好方面发展，但受困于种种政治限制，步子不可能迈得太大。但在“胡连会”和“胡宋会”的指向下，再加上陈水扁第二个四年任期的倒行逆施、贪贿枉法，才为扭转两岸关系方向积蓄了更大的能量。延误了四年的“损失”，只不过在一年间便夺回来了，而且后续势头将更迅更猛，正所谓“走得快不如走得好”。

    因此就此而言，在客观上，枪击案也为台湾政治前途及台海局势发展方向，催生了重大的正面效应。